Chương trình Du lịch về cội nguồn của 3 tỉnh được xây dựng với 9 nội dung chính và 15 nội dung phụ trợ; các hoạt động được tổ chức trên địa bàn 3 tỉnh gồm: các hoạt động văn hóa, lễ hội hướng về cơ sở giới thiệu nét văn hóa đặc trưng của các dân tộc, vùng miền của ba tỉnh; đầu tư có trọng tâm trọng điểm, đi vào chiều sâu, bền vững, xây dựng cơ sở hạ tầng, sản phẩm thương hiệu du lịch, đẩy mạnh công tác xã hội hóa du lịch; tiếp tục đổi mới về nội dung, hình thức, tuyên truyền giới thiệu, quảng bá tiềm năng du lịch. Với các sản phẩm du lịch, 3 tỉnh sẽ khảo sát và kết nối tour chuyên đề như du lịch tâm linh dọc sông Hồng: Đền Hùng (Phú Thọ) - đền Bảo Hà (Yên Bái) - đền Thượng (Lào Cai); phát triển sản phẩm du lịch ruộng bậc thang dọc tuyến đường 32 từ Phú Thọ - Nghĩa Lộ - Mù Căng Chải (Yên Bái) - Sa Pa (Lào Cai) - Nguyên Dương (Vân Nam, Trung Quốc), đồng thời xây dựng các loại hình du lịch mạo hiểm, tour khám phá bản làng các dân tộc ở cả ba tỉnh. Trong thời gian diễn ra chương trình Du lịch về cội nguồn năm 2011, tỉnh Yên Bái còn tổ chức Tuần văn hóa du lịch cộng đồng dân tộc “Trẩy hội mùa xuân” tại các xã, phường, thị trấn trong toàn tỉnh. Bà Phạm Thị Thanh Trà, Phó Chủ tịch thường trực UBND tỉnh Yên Bái, cho biết: Nét mới của chương trình Du lịch về cội nguồn năm 2011 là tập trung tổ chức các hoạt động lễ hội tại cơ sở để khai thác có hiệu quả những nét văn hóa đặc sắc ở bản làng các dân tộc Mông, Dao, Thái, Tày... để hình thành sản phẩm đặc trưng của vùng là du lịch sinh thái - văn hóa - lịch sử. Kinh phí tổ chức các hoạt động trong chương trình này chủ yếu từ nguồn xã hội hóa, UBND 3 tỉnh chỉ hỗ trợ một phần rất nhỏ cho các địa phương, chủ yếu là các địa phương khó khăn.

Năm 2011 là năm thứ bảy, 3 tỉnh Lào Cai - Yên Bái - Phú Thọ liên kết làm chương trình Du lịch về cội nguồn. Chương trình liên kết phát triển này đã để lại ấn tượng tốt với nhân dân, du khách trong và ngoài nước, góp phần đổi mới diện mạo du lịch vùng miền núi Tây Bắc. Năm 2010, qua chương trình Du lịch về cội nguồn, lượng khách đến 3 tỉnh đạt 2 triệu lượt người, doanh thu du lịch ước đạt 1.000 tỉ đồng.